2-피론4,6-지카르본산라크트나제
| 2-피론4,6-지카르본산라크트나제(LigI) | |||||||||
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| 식별자 | |||||||||
| EC번호 | 3.1.1.57 | ||||||||
| CAS 등록 번호 | 84177-55-9 | ||||||||
| 데이터 베이스 | |||||||||
| IntEnz | IntEnz view | ||||||||
| BRENDA | BRENDA entry | ||||||||
| ExPASy | NiceZyme view | ||||||||
| KEGG | KEGG entry | ||||||||
| MetaCyc | metabolic pathway | ||||||||
| PRIAM | profile | ||||||||
| PDB 구조 | RCSB PDB PDBe PDBj PDBsum | ||||||||
| 유전자 온트로지 | AmiGO / EGO | ||||||||
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2-피론4,6-지카르본산라크트나제(2-pyrone-4, 6-dicarboxylate lactonase, EC 3.1. 1.57)은, 다음 화학반응을 가역적으로 가수분해하는 효소이다.
- 2-피론4,6-지카르본산+ H2O 4-카르보키시2-히드록시 헥사-2,4-지엔 이산 4-오키사로메사콘산
따라서, 이 효소의 기질은,2-피론4,6-지카르본산[1]과 물, 생성물은4-오키사로메사콘산[2]로4-카르보키시2-히드로키심콘산의 호변이성체의 혼합물인[3].
이 효소는 아미드히드로라제의 효소에 속해, Cluster of Orthologous Groups(COG) 3618을 구성한다.계통명은 2-pyrone-4, 6-dicarboxylate lactonase이지만, LigI로서도 알려진다.이 효소는, 시린가산분해 경로[4]로 프로트카테크산4,5-개렬경로[5]에 있어서의 리그닌 유래 방향족 화합물의 대사에 대해 중요한 역할을 완수한다.
스핀고모나스 유래의 LigI는, 2값의 금속 양이온을 효소 활성에 필요로 하지 않는 처음으로 발견된 아미드히드로라제로서 특히 중요한[6].
반응 기구
LigI의 촉매 반응 기구는, 결정학과 NMR 분석에 의해 밝혀지고 있다.구체적으로는, 가수분해를 일으키는 수분자가 Asp-248에의 플로톤 이동에 의해서 활성화 되어2-피론4,6-지카르본산(PDC ) 락톤의 카르보닐기는 His-180, His-31 및 His-33으로 수소결합에 의한 상호작용으로 활성화 되는[6].
출전
- ^"2-pyrone-4, 6-dicarboxylate". MetaCyc. SRI International. 2013년 9월 1일 열람.
- ^ "(1 E)-4-oxobut-1-ene-1, 2,4-tricarboxylate". MetaCyc. SRI International. 2013년 9월 1일 열람.
- ^ "(1 Z, 3 Z)-4-hydroxybuta-1, 3-diene-1, 2,4-tricarboxylate". MetaCyc. SRI International. 2013년 9월 1일 열람.
- ^"syringate degradation". MetaCyc. SRI International. 2013년 9월 1일 열람.
- ^"protocatechuate degradation I (meta-cleavage pathway)". MetaCyc. SRI International. 2013년 9월 1일 열람.
- ^ a b Hobbs ME, Malashkevich V, Williams HJ, Xu C, Sauder JM, Burley SK, Almo SC, Raushel FM (April 2012). "Structure and Catalytic Mechanism of LigI: Insight into the Amidohydrolase Enzymes of cog3618 and Lignin Degradation". Biochemistry. doi:10.1021/bi300307b. PMID 22475079.
참고 문헌
- Kersten PJ, Dagley S, Whittaker JW, Arciero DM, Lipscomb JD (1982). "2-pyrone-4, 6-dicarboxylic acid, a catabolite of gallic acids in Pseudomonas species". J. Bacteriol. 152 (3): 1154□62. PMC 221622. PMID 7142106.
- Maruyama K (Tokyo). "Purification and properties of 2-pyrone-4, 6-dicarboxylate hydrolase". J. Biochem. (2): 557□65. PMID 6841353.
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