정보 플랫폼
목차
목적・달성 목표
정보 플랫폼(정보 PF)은, 타겟 단백 연구 프로그램으로 생성되는 데이터・정보・지식의 공유를 실현하고, 연구 성과의 최대화에 공헌하는 것과 동시에, 단백질 과학의 정보 기반으로서 차세대에게 계승해 가는 것을 목적으로 하고 있다.
구체적으로는, 정보 매니지먼트 시스템(정보 MS)과 타겟 단백질 종합 데이터 베이스(타겟 DB)의 디지털로부터의 어프로치와 사무국에 의한 아날로그로부터의 어프로치에 의해서, 타겟 단백 연구 분야 및 기술개발 3 영역(생산・해석・제어)의 연구 거점으로부터 낳아지는 데이터와 정보의 집약, 프로젝트 내정보공유의 촉진, 정보의 지식화, 및 적절한 외부 발신의 실현을 목표로 하고 있다.
연구의 배경
「단백 3000 프로젝트」는 2006년도로서 종료했지만, 그 후도 「단백 3000 성과 데이터 베이스」에 의해서, 대상이 된 단백질에 대해 각 거점에서의 진척 결과를 열람할 수 있다.
이것을 한층 더 진행하고, 연구 개시부터 연구 성과 공표까지의 진척 상황을 리얼타임에 파악 가능하게 하는 정보 시스템이, 2006년도에 있어서의 「단백질 해석 기반기술 개발 프로젝트(기반 프로젝트)」의 1 과제 「차세대 단백질 해석을 향한 정보 플랫폼의 구축과 전략적 활용」으로서 국립 유전학 연구소와 히타치 제작소 중앙연구소에 의해서 시작되었다.
2007년도부터의 타겟 단백 연구 프로그램에 대해서는, 이것들 단백 3000 프로젝트 및 기반 프로젝트로 얻은 지견을 살리고, 데이터・정보・지식의 프로젝트내 공유와 외부 발신을 위한 플랫폼이 구축되어 운용되고 있다.
진척 상황
정보 MS와 타겟 DB의 요소 기술의 개발과 그러한 통합 및 이용자와의 인터페이스가 되는 포털 사이트가 2008년 6월에 공개되었다.포털 사이트에는 타겟 단백 연구 프로그램의 연구 실시자나 평가자를 위한 공유 포털 사이트와 프로그램의 성과를 넓게 보급하기 위한 공개 포털 사이트가 있다.
정보 PF 중 정보 MS에 의해서, 타겟 단백 연구 프로그램의 연구 실시자나 프로그램의 평가자는, 진척 상황, 실험 프로토콜, 논문・특허를 확인할 수 있다.또, 공유 사이트에서는, 업무 계획서나 성과 보고서도 열람할 수 있는 것과 동시에, 업무 계획서에 기재된 목적, 정보 MS에 등록된 논문, 특허 및 학회 발표가 파묻힌 연도 보고서를 반자동 생성이 가능하게 되어 있다.
정보 PF 중 타겟 DB로는, 배열 기능 정보 기반 DB(배열 DB), 구조 기능 정보 기반 DB(구조 DB), 화합물 DB 및 단백질 네트워크 정보 기반 DB(TP Atlas)의 4개 골조로 다양한 하부조직이 가동하고 있다.
관련 항목
참고 문헌
스가와라 히데아키・나카무라 하루키・카네코 아키히토・오노 미에 타겟 단백 연구 프로그램 정보 플랫폼/Information platform of targeted proteins research program (특집호 「융합 발전하는 구조 생물학과 케미컬 바이올로지의 최전선」) 단백질 핵산 효소 54(12), 1530-1534, 2009
외부 링크
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